细菌性阴道炎是不会影响月经的。因为月经是因为激素水平的周期性改变形成的，而阴道炎则是由于阴道的上皮细胞发生了炎症引起的一种病症，因此两者并没有关系。

月经的发生和下丘脑及卵巢有关，下丘脑支配卵巢后会导致卵巢发生周期性排卵，而在卵巢排卵过程中，雌激素会经历两个高峰期，即排卵期和月经前的高峰。孕激素经历一个高峰期就是从无一直到月经前的高峰期，在雌激素和孕激素同时达到高峰期后会撤退，导致内膜不能支持发生月经，而这个过程与细菌性阴道炎是完全没有关系的。

细菌性阴道炎的发病原理则主要是由于阴道的上皮细胞发生了炎症，从而可刺激分泌物增多，因此多数细菌性阴道炎会表现为分泌物增多、有异味。从细菌性阴道炎的发病原理可知其和月经是没有任何的交汇点的。

细菌性阴道炎虽然不会影响到月经，但对女性健康不利，因此要及时治疗。一般可用栓剂或口服甲硝唑类药物来治疗，治疗一周左右的时间基本就可达到治愈的效果，不过停药后要注意复查，以明确是否彻底治愈。